Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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