Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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