Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms