Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.8 ms