Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hdac5Q9Z2V6 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms