Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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