Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Atg4aQ8C9S8 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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