Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms