Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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