Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc18Q640L5 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms