Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r53-201ENSMUST00000170412 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 4933431E20Rik-210ENSMUST00000152663 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm45694-201ENSMUST00000212022 3251 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Smok3c-201ENSMUST00000110967 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Lrrc43Q3V0L5 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 CT009518.1-201ENSMUST00000224886 1571 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms