Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpusd2Q149F1 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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Rpusd2Q149F1 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpusd2Q149F1 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms