Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd13P70217 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hoxd13P70217 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd13P70217 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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