Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rps27aP62983 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms