Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Cldn18P56857 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Cldn18P56857 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Cldn18P56857 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn18P56857 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms