Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms