Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gjb1P28230 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms