Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
DmdP11531 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
DmdP11531 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
DmdP11531 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
DmdP11531 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
DmdP11531 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms