Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChmQ9QXG2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms