Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Trim39Q9ESN2 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Trim39Q9ESN2 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Trim39Q9ESN2 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Trim39Q9ESN2 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Trim39Q9ESN2 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Trim39Q9ESN2 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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