Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccser1Q8C0C4 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms