Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Dsg1bQ7TSF1 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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