Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx13Q6PHS6 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms