Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms