Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Top2aQ01320 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms