Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
H3f3aP84244 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H3f3aP84244 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms