Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxc13P50207 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc13P50207 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms