Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ggta1P23336 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ggta1P23336 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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