Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P20040 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P20040 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
P20040 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P20040 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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