Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Usp9yF8VPU6 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms