Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Scn3aA2ASI5 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Scn3aA2ASI5 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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