Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrit3W8DXL4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrit3W8DXL4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrit3W8DXL4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms