Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tulp1Q9Z273 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tulp1Q9Z273 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms