Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ilf3Q9Z1X4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms