Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr4Q9Z1L2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngr4Q9Z1L2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms