Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cog1Q9Z160 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog1Q9Z160 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms