Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmg20bQ9Z104 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms