Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1a4Q9WV27 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1a4Q9WV27 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms