Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Opn3Q9WUK7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Opn3Q9WUK7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn3Q9WUK7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Opn3Q9WUK7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Opn3Q9WUK7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Opn3Q9WUK7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Opn3Q9WUK7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Opn3Q9WUK7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms