Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lemd3Q9WU40 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lemd3Q9WU40 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms