Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd7Q9WTY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd7Q9WTY1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms