Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdh13Q9WTR5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdh13Q9WTR5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms