Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TapbpQ9R233 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms