Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim3Q9R1R2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim3Q9R1R2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim3Q9R1R2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim3Q9R1R2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim3Q9R1R2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim3Q9R1R2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms