Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lhx6Q9R1R0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms