Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psma4Q9R1P0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms