Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc26a4Q9R155 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc26a4Q9R155 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms