Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms