Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Wdr54Q9R0D8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms