Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms